Das klingt für mich schon sehr nach den Lautsprechern. Sprich wenn Windows die Sondtreiber lädt/entlädt und die Lautsprecher somit aktiviert/deaktiviert werden.
Einzig merkwürdige ist, dass es ausschliesslich von der rechten Seite kommt. Kann es sein das Du es nur so wahr nimmst?
Oder das Knacken kommt vom CD/DVD Laufwerk bzw. dessen Verriegelung. Ist jetzt allerdings schwierig da genaueres zu sagen da man das Geräusch selber hören müsste. Würde aber mal von ausgehen, wenn das System ansonsten stabil läuft und es keine Probleme gibt, dass es nichts ist weshalb man sich sorgen machen braucht.